Ziel des Pokémon TCGs ist es die 6 Preiskarten zu ziehen, indem man genügend Pokémon des Gegners kampfunfähig macht.

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Für das Spiel werden zwei Decks mit jeweils 60 Karten, eine Münze (oder ein Würfel) und Schadensmarken (man kann ebenfalls Würfel verwenden) gebraucht. Jeder Spieler mischt sein Deck und zieht dann eine Starthand von 7 Karten. Nun müssen beide Spieler schauen, ob sie ein Basis-Pokémon auf ihrer Hand halten. Wenn ja, dann wird ein Basis-Pokémon verdeckt in die aktive Position gelegt und bis zu 5 Pokémon auf die eigene Bank. Falls ein Spieler kein Basis-Pokémon hält, muss dieser seine Starthand dem Gegner zeigen, sie zurück ins Deck mischen und neue 7 Karten ziehen. Der Gegner darf nun, falls er selbst ein Basis-Pokémon hat, eine zusätzliche Karte ziehen. Jetzt legt jeder Spieler 6 Preiskarten von seinem Deck verdeckt neben das Spielfeld, ohne sie vorher anzusehen. Mit einer Münze oder einem Würfel wird nun entschieden, welcher Spieler beginnt. Nun werden alle Basis-Pokémon umgedreht und das Spiel beginnt.

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Der erste Zug:
Am Anfang jedes Zuges zieht der jeweilige Spieler immer eine Karte, bevor er alles Weitere tut. Der beginnende Spieler muss beachten, dass er in seinem ersten Zug keine Trainer-, Unterstützer- und Stadionkarten von seiner Hand ausspielen darf. Er darf eine Energiekarte von der Hand an eines seiner Pokémon anlegen, ggf. Poké-Power von seinen Pokémon verwenden und zum Schluss angreifen. Außerdem dürfen beide Spieler in ihrem ersten Zug noch keine Pokémon entwickeln. Nachdem der Angriff ausgeführt wurde ist der Zug zuende und der andere Spieler ist an der Reihe.
Dieser darf nun auch Trainerkarten von seiner Hand spielen, da er nicht der beginnende Spieler ist. Entwickeln darf er jedoch noch nicht.

Folgende Züge:
Ab dem zweiten Zug dürfen beide Spieler ihre Pokémon entwickeln. Alle folgenden Züge sind nun gleich aufgebaut - es können Energiekarten angelegt, Trainerkarten gespielt, Pokémon entwickelt, Poké-Power benutzt und Angriffe verwendet werden. Die Reihenfolge dieser Aktionen ist beliebig, allerdings ist nach dem Angriff der eigene Zug beendet. Man kann seinen Zug auch beenden ohne anzugreifen. In beiden Fällen ist dies die letzte Aktion des Spielers in seinem Zug. Wenn ein Pokémon des Gegners kampfunfähig gemacht wurde, dann darf man eine seiner Preiskarten ziehen. Ein Pokémon ist kampfunfähig, wenn auf ihm mindestens so viele Schadenspunkte liegen wie es Kraftpunkte (KP) besitzt.

Zwischen den Zügen:
Zwischen den Zügen der beiden Spieler - also nachdem Spieler 1 seinen Zug beendet hat, aber noch bevor Spieler 2 seinen Zug beginnt - werden sämtliche Effekte verrechnet, die sich auf diese Phase zwischen den Zügen beziehen. Dazu gehören u.a. Spezielle Zustände, manche Angriffe und Poké-Power/Body sowie einige Stadionkarten. Auch zwischen den Zügen können Pokémon kampfunfähig werden, sodass der jeweilige Spieler eine Preiskarte ziehen darf. Erst wenn alle Effekte berücksichtigt und angewendet wurden beginnt der Zug von Spieler 2 mit dem Ziehen einer Karte.

Spielende:
Das Spiel ist beendet, wenn...

• ein Spieler alle 6 Preiskarten gezogen hat
• ein Spieler keine Pokémon mehr hat (dieser verliert das Spiel)
• ein Spieler zu Beginn seines Zuges keine Karte mehr vom Deck ziehen kann, also "decktot" ist